W przeszłości Wojciech Szelągowski pracował m.in. w Polskim Górnictwie Naftowym i Gazownictwie SA jako wicedyrektor finansowy, gdzie odpowiadał za organizację finansowania  dla spółki, w tym m.in. program emisji euroobligacji. Brał udział w negocjacjach kontraktów handlowych na dostawy gazu, w tym z duńskim DONG i norweskim Statoil.

Ponadto uczestniczył w procesie prywatyzacji jednego z największych polskich przedsiębiorstw z branży motoryzacyjnej FSM, przejętego przez włoskiego FIAT-a, pracował również w firmie doradczej Arthur Andersen, Telekomunikacji Polskiej (dyrektor departamentu finansów grupy kapitałowej), a także HSBC Bank Polska. Od 2006 do 2008 r. był wiceprezesem Polskiej Agencji Informacji i Inwestycji Zagranicznych, gdzie zajmował się współpracą z inwestorami zagranicznymi i prowadzeniem negocjacji.

Operator Gazociągów Przesyłowych Gaz-System S.A. to spółka strategiczna dla polskiej gospodarki, odpowiedzialną za przesył gazu ziemnego oraz zarządzanie najważniejszymi gazociągami w Polsce. Jest również właścicielem spółki Polskie LNG S.A., powołanej do budowy terminalu skroplonego gazu ziemnego LNG w Świnoujściu.