Przepompownia stoi na rogu al. Waszyngtona i Międzynarodowej, na skraju parku Skaryszewskiego. Zaplanowano ją pół wieku temu, ale budowa ruszyła dopiero przed 29 miesiącami.
Przepompownia pozwoli na zamknięcie dwóch innych, tymczasowych. Były już tak przeciążone, że ulewy groziły podtopieniami sąsiednich budynków. Dzięki Saskiej Kępie II ścieki m.in. z Pragi, Wawra czy Wesołej trafią do oczyszczalni ścieków Czajka w Białołęce. Po drodze wpłyną jeszcze do przepompowni Żerań. Podróż z przepompowni trwa pięć godzin.

Serce przepompowni jest kilkanaście metrów pod ziemią. Jest tam sześć pomp, które tłoczą nieczystości. Wcześniej są one nieco "przecedzone", aby większe odpadki nie spowodowały np. awarii. Na kratach zostają np. gałęzie po burzy czy szmaty. Zbudowano też sześć pomp dodatkowych, które będą uruchamiane w czasie silnych deszczów.
Przepompownia Saska Kępa II kosztowała 36,3 mln zł. Wybudowało ją konsorcjum firm PBG SA Wysogotowo k. Poznania oraz Hydrobudowa Włocławek.