Oczyszczalnia kosztowała 47 mln euro, ponad 65 procent  kosztów budowy pokrytych zostało z unijnego Funduszu Spójności.  Inwestycja zrealizowana została w ramach wartego 282,24 mln euro kompleksowego programu "Poprawa jakości wody w Szczecinie". Udział Funduszu Spójności w całej inwestycji wynosi 186 mln euro. Pozostałą część stanowią środki własne zakładu (27 mln euro) oraz pożyczeki z Narodowego i Wojewódzkiego Funduszy Ochrony Środowiska i z Banku Ochrony Środowiska.
Program podzielono na 24 kontrakty, które dotyczyły m.in. renowacji starego systemu wodno-kanalizacyjnego, budowy dwóch pompowni, nitki magistrali dostarczającej wodę do miasta.