Przewiduje się, że perspektywicznymi surowcami do produkcji biopaliw będą: wszelkie substancje odpadowe, w tym odpadowa biomasa oraz w dalszej kolejności odpadowy ditlenek węgla, a nawet para wodna. Ze względu na uwarunkowania środowiskowe ostrożnie należy podchodzić do upraw roślin energetycznych jako surowca. Współczesny stan wiedzy określa jako w miarę bezpieczne uprawy jatrofy, lnicznika, halofitów i alg, które mogą stanowić surowce do otrzymywania biopaliw. Potrzeba poszukiwania nowych surowców niezbędnych dla produkcji biopaliw jest szczególnie istotna w krajach europejskich