Linia nr 3 będzie miała 5,8 km długości, a jej otwarcie zaplanowano na 2012 rok. Zostanie wybudowanych siedem nowych stacji. Tunel pomiędzy Txurdinaga i Casco Viejo realizowany jest przez konsorcjum firm Sacyr Vallehermoso S.A./Cavosa Obras y Proyectos S.A./Altuna y Uria S.A.

W przyszłości planowane jest doprowadzenie metra do międzynarodowego portu lotniczego. Projekt będzie wymagał wykonania dwóch równoległych tuneli o długości 1,9 km przebiegających pod  Mount Artxanda.